#bioinformatic
β-sheet (b-pleated qatlam) alfa spiralga nisbatan bir oz kam uchraydigan oqsilning ikkilamchi tuzilish shaklidir. β-sheet ikki yoki uchta vodorod bog'lari bilan yonma-yon bog'langan beta zanjirlaridan (iplardan) iborat bo'lib, biroz burishgan, buklangan sheetlarni hosil qiladi. Bir nechta beta-sheetlarning kombinatsiyasi ko'plab inson va hayvonlar kasalliklarida, xususan, amiloidozlarda (shu jumladan Altsgeymer kasalligida) kuzatiladigan oqsil agregatlari va fibrillalarning shakllanishiga olib kelishi mumkin.
Alfa spiral (α-spiral) oqsillarning ikkilamchi strukturasining elementi bo'lib, o'ng qo'lli spiral shakliga ega bo'lib, unda har bir amino guruhi (-NH) karbonil guruhi bilan vodorod aloqasini hosil qiladi (- C=O). Ushbu ikkilamchi tuzilish elementi ba'zan klassik Pauling-Corey-Branson alfa spiral deb ham ataladi.
Ideal a-spiralning parametrlari:
aminokislota qoldiqlari soni spiralning har bir aylanishida 3,6-3,7;
spiral diametri - 1,5 nm;
spiral qadami - 0,54 nm;
Har bir aminokislota qoldig'ida 0,15 nm mavjud.
Bunday parametrlar a-spiralga kiritilgan barcha aminokislotalar qoldiqlarining (ph va ps burchaklari) konformatsiyasi bir xil degan taxmin asosida hisoblab chiqilgan. Biroq, haqiqiy oqsillarda alohida aminokislota qoldiqlarining konformatsiyasi bir oz farq qiladi, bu esa spiral o'qining ozgina egriligiga, spiral burilishlarida turli xil miqdordagi aminokislotalar qoldiqlariga va hokazolarga olib kelishi mumkin.
Lesson time.
β-sheet (b-pleated qatlam) alfa spiralga nisbatan bir oz kam uchraydigan oqsilning ikkilamchi tuzilish shaklidir. β-sheet ikki yoki uchta vodorod bog'lari bilan yonma-yon bog'langan beta zanjirlaridan (iplardan) iborat bo'lib, biroz burishgan, buklangan sheetlarni hosil qiladi. Bir nechta beta-sheetlarning kombinatsiyasi ko'plab inson va hayvonlar kasalliklarida, xususan, amiloidozlarda (shu jumladan Altsgeymer kasalligida) kuzatiladigan oqsil agregatlari va fibrillalarning shakllanishiga olib kelishi mumkin.
Alfa spiral (α-spiral) oqsillarning ikkilamchi strukturasining elementi bo'lib, o'ng qo'lli spiral shakliga ega bo'lib, unda har bir amino guruhi (-NH) karbonil guruhi bilan vodorod aloqasini hosil qiladi (- C=O). Ushbu ikkilamchi tuzilish elementi ba'zan klassik Pauling-Corey-Branson alfa spiral deb ham ataladi.
Ideal a-spiralning parametrlari:
aminokislota qoldiqlari soni spiralning har bir aylanishida 3,6-3,7;
spiral diametri - 1,5 nm;
spiral qadami - 0,54 nm;
Har bir aminokislota qoldig'ida 0,15 nm mavjud.
Bunday parametrlar a-spiralga kiritilgan barcha aminokislotalar qoldiqlarining (ph va ps burchaklari) konformatsiyasi bir xil degan taxmin asosida hisoblab chiqilgan. Biroq, haqiqiy oqsillarda alohida aminokislota qoldiqlarining konformatsiyasi bir oz farq qiladi, bu esa spiral o'qining ozgina egriligiga, spiral burilishlarida turli xil miqdordagi aminokislotalar qoldiqlariga va hokazolarga olib kelishi mumkin.
Lesson time.